凡例八則
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一，是書先尊《神農本經》，次錄陶弘景《別錄》，次《唐本草》、唐《新定本草》，次甄權《藥性本草》，次孫思邈《千金·食治》，次陳藏器《本草拾遺》，次《蜀昶本草》，次宋《開寶本草》，次宋《嘉祐本草》，次《日華本草》，次東垣《用藥法象》，次丹溪《衍義補遺》，以至會編《蒙筌》，並元、明舊本，不下四十餘種，最後李氏萍湖《本草綱目》。該博倍於前人，第書中兼收並列，已盡辨別之功。後賢證驗確論，每多重載。（謨）更加甄羅補訂，刪繁去冗，僭曰《匯言》，志核也，志純也。
一，本草諸書，可云淵廣，然歷考之，主其說而古今人有不然者，是知用藥之神妙，非可執一，不容顢頇弗辯也。謨搜輯往代名言，庶無滲漏，復自周遊省直，於部邑市廛，幽巖隱谷之間，遍訪耆宿，登堂請益，採其昔所未詳，今所屢驗者，一一核載，校李氏原本，稍有減增，用供國手之取裁，殊有大裨云。
一，論藥集方，必見諸古本有據，時賢有驗者，方敢信從。每論每方，必注姓氏、出處，公諸天下。猶恐字有訛脫貽誤於人，復再三考訂而存之締，觀旁註略見苦心，至於芟繁汰復，尤不待言。
一，藥品既詳辯其味、其氣、其性之有毒無毒，力之升降浮沉，入某經，列於首條。次載生成出處，何時發生，何時收聚形，與何藥相似。搜訂前言真確有據，仍列前人姓氏，廣《綱目》之未備者殊多。
一，本草諸書先敘氣味、陰陽、升降，莫不亟言主治，但云主治者，必出於獨斷獨用乃可。是書備引古今名家，未拘一說，故不得直標主治二字。觀其主論處方，即可以意消息之。庶一藥不執於一說，不滯於一用，而化裁出焉，識者鑑之。
一，凡藥治病有所宜者，必有所忌者，取所宜而不知所忌，以致愈而復發，發而轉劇，或別變他證者，往往有焉。茲列其宜，必詳陳其忌，可為取捨之淮。
一，神農嘗百草而定藥，故其書曰本草，意必先以草為正嗣，後果、木、金、石、禽、魚等類繼之，故集中先列草部，然取藥求其切於治病耳，方士家謂可以供爐鼎服食，如先賢韓柳歷陳服鍾乳金丹之誤，不止一人，下及砒石可化熱痰，生漆可補腦髓，一切荒誕之談誤聽之，而橫夭者多矣，概屏不錄，所以正道術，辟邪說也。
一，集古今原本，無取卮詞失實，然《綱目》臚列繁碎，難於記誦，集中俱融貫為章句，可讀可記，不致顧此失彼，神而明之，於是乎在。
一，是書先尊《神農本經》，次錄陶弘景《別錄》，次《唐本草》、唐《新定本草》，次甄權《藥性本草》，次孫思邈《千金·食治》，次陳藏器《本草拾遺》，次《蜀昶本草》，次宋《開寶本草》，次宋《嘉祐本草》，次《日華本草》，次東垣《用藥法象》，次丹溪《衍義補遺》，以至會編《蒙筌》，並元、明舊本，不下四十餘種，最後李氏萍湖《本草綱目》。該博倍於前人，第書中兼收並列，已盡辨別之功。後賢證驗確論，每多重載。（謨）更加甄羅補訂，刪繁去冗，僭曰《匯言》，志核也，志純也。
一，本草諸書，可云淵廣，然歷考之，主其說而古今人有不然者，是知用藥之神妙，非可執一，不容顢頇弗辯也。謨搜輯往代名言，庶無滲漏，復自周遊省直，於部邑市廛，幽巖隱谷之間，遍訪耆宿，登堂請益，採其昔所未詳，今所屢驗者，一一核載，校李氏原本，稍有減增，用供國手之取裁，殊有大裨云。
一，論藥集方，必見諸古本有據，時賢有驗者，方敢信從。每論每方，必注姓氏、出處，公諸天下。猶恐字有訛脫貽誤於人，復再三考訂而存之締，觀旁註略見苦心，至於芟繁汰復，尤不待言。
一，藥品既詳辯其味、其氣、其性之有毒無毒，力之升降浮沉，入某經，列於首條。次載生成出處，何時發生，何時收聚形，與何藥相似。搜訂前言真確有據，仍列前人姓氏，廣《綱目》之未備者殊多。
一，本草諸書先敘氣味、陰陽、升降，莫不亟言主治，但云主治者，必出於獨斷獨用乃可。是書備引古今名家，未拘一說，故不得直標主治二字。觀其主論處方，即可以意消息之。庶一藥不執於一說，不滯於一用，而化裁出焉，識者鑑之。
一，凡藥治病有所宜者，必有所忌者，取所宜而不知所忌，以致愈而復發，發而轉劇，或別變他證者，往往有焉。茲列其宜，必詳陳其忌，可為取捨之淮。
一，神農嘗百草而定藥，故其書曰本草，意必先以草為正嗣，後果、木、金、石、禽、魚等類繼之，故集中先列草部，然取藥求其切於治病耳，方士家謂可以供爐鼎服食，如先賢韓柳歷陳服鍾乳金丹之誤，不止一人，下及砒石可化熱痰，生漆可補腦髓，一切荒誕之談誤聽之，而橫夭者多矣，概屏不錄，所以正道術，辟邪說也。
一，集古今原本，無取卮詞失實，然《綱目》臚列繁碎，難於記誦，集中俱融貫為章句，可讀可記，不致顧此失彼，神而明之，於是乎在。